Le bâtiment néo-Renaissance du Musée municipal fut édifié entre 1895 et 1898 dans la rue na Poříčí, sur les plans de l’architecte Antonín Balšánek. La façade de ce bâtiment à deux étages est dominée par une sculpture frontale représentant de façon allégorique intitulée l’Histoire, l’art, la science et les métiers font la gloire de notre passé, ainsi que d'une Allégorie de Prague, œuvres du sculpteur Ladislav Šaloun.
La pièce la plus remarquable du Musée est une maquette en papier de Prague représentant le centre historique de Prague et
réalisée entre 1826 et 1837 par Antonín Langweil, à l’époque employé de la bibliothèque universitaire. Sur une surface d’environ vingt mètres carrés se trouvent représentés, à une échelle de 1:480, plus de 2000 bâtiments du cœur historique de Prague, dont près de la moitié n’existe plus aujourd’hui. Cette maquette représente la Vieille Ville avec le ghetto juif, Malá Strana, le Château de Prague et le Hradčany. Elle est faite à base de carton et comprend des éléments en bois, dont est constituée la plupart des maisons et des cheminées.
